ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后，小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中，他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”（基格尔德·核心）及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
游戏降临现实，世界规则颠覆，人类进入全民转职时代。 唯有成为转职者！升级变强！方能站上世界之巅！ 转职当天，林默语成为唯一性隐藏职业，死灵法师。 从此召唤物不死绝，林默语便不会死。 “我高坐骸骨神座，行走生死之间。” “我即是天灾！”
机械帝国·黑岩浆企图征服世界，它利用高科技制造出一连串大灾害，并在联合国会议中向人类宣战。因此，联合国一致通过组建“太阳战队”的方案，让太阳战队与机械帝国黑岩浆对抗。
