ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
“想洗清嫌疑,方法有很多,语言辩解只是其中的一种,但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法!”紫川秀,这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领,在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下,成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王,诞生了!
在2016年电影的事后,弗兰克、布伦达、巴瑞和萨米试图建立自己的食物社会。
2022年,一场未来战争在少数人类幸存者和无穷无尽的机器大军之间激烈进行了数十年。1997年,被称为“天网”的人工智能获得了自我意识,并向人类开战。一名被送往过去改变人类命运的士兵被夹在未来和过去之间。她来到1997年,任务是保护一位名叫马尔科姆·李的科学家。这位科学家致力于推出一种新的人工智能系统,以对抗“天网”即将对人类发出的攻击。马尔科姆一面应对其发明所涉及的复杂的道德问题,一面遭到来自未来的无情杀手的追杀,而这永远改变了他三个孩子的命运。