在遥远的神话时代,人类私欲膨胀,相互残杀,人世间血雨腥风,哀鸿遍野。人类仇恨的力量创造了妖邪界及其魔王霸主阿罗醐,阿罗醐的出现是人类的命运更加黯淡无光。这时,身穿金色铠甲的勇士迦雄须出现,打败了阿罗醐,还世界以光明。然阿罗醐虽死,其聚集了邪念铠甲却还留存世间。为了抑制住邪恶的力量,迦雄须用“仁、义、礼、智、信、忠、孝、悌、忍”九种人类精神将其封印。 一千年倏忽而去,公元1988年,妖邪帝王之城阿罗醐城出现东京上空,黑暗再次降临。就在人类世界危在旦夕之时,五位身穿铠甲救世主挺身而出……
打造一个所有人都能读到书的世界成为神殿的青衣见习巫女的梅茵,和路兹、多莉以及孤儿院的孩子们一起制作了儿童用的圣典绘本。对书本的热情有增无减的梅茵,赋予了约翰与海蒂"古腾堡"的封号后,向下一个目标"活版印刷"迈进。然而,梅茵的前方却是一片乌云笼罩。察觉到拥有强大魔力与奇异知识的梅茵具有利用价值的贵族、以及对梅茵怀恨在心的贵族,暗中盯上了梅茵。
当初为了避开巨人的进攻,人类修建了地下街道,不过这项企划很快废止,地下街最终成为贫民与无法之徒的栖息之所。利威尔(神谷浩史 配音)和法兰是一对好朋友,他们自行学会了立体机动装置,渴望有朝一日沐浴在阳光雨露之下。偶然的机会他们救助了被人追杀的女孩伊莎贝尔,伊莎贝尔则恳求二人教她使用立体机动装置。在此之后,他们被神秘政客召唤,要求执行一项绝密任务,以赢得地面居住权。行动中他们遭到调查团的追捕,埃尔文·史密斯(小野大辅 配音)欣赏利威尔等人的实力,于是将其招入调查团中。 三个少年如愿走上地面,不过他们仍没忘记未完成的任务…