在充满音乐风情的城市-加音町成长的青梅竹马北条响和南野奏,虽然升上国中后的二人个性总是不合,但却因着相同的兴趣“音乐”而有了连结。某天响与奏正巧在旧歌剧院撞见时,音乐王国“大调岛”的精灵-哈咪出现了,为了不让“小调岛”的敌人继续将传说的乐谱中“幸福的旋律”变成“不幸的旋律”音符,所以找寻能够以“高音谱记号”变身为光之美少女的响与奏。以二人合而为一的正义之心,一齐找寻飞散到人间的旋律音符,和小调岛的敌人来场音符抢夺战!
衰仔高三生路明非,突然收到了一封来自卡塞尔学院的邀请信,这一件天上掉馅饼的大好事砸得他有一些不知所措,经历了一系列事件后,路明非决定面对未知,加入卡塞尔,谁知竟被告知,卡塞尔的学习之旅是为了——屠龙。学院“自由一日”和“3E”考试等等不同寻常的事件让他不得不相信自己真的加入了一个目标是屠龙的神秘组织,随后去往青铜城的行动也让他直面了自己已然到来的、不平凡且残酷的人生……
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
自世界各地出现连接异次元与现实世界的通路「传送门」,已过了十多年。觉醒了特殊能力,被称为「猎人」的人们,与存在于传送门里地下城内的魔兽不断厮杀。猎人的能力在觉醒后就不再有成长空间,其等级也不会再有变化。然而,被称作是人类最弱兵器的程肖宇,在一次双重地下城的突击任务中得到了只有自己能够「升级」的能力,得以在战斗中不断变强。顺利通过转职任务,得到能操纵暗影士兵的职业「暗影君主」的肖宇,为了取得或许能医治母亲病情的道具「生命神水」的素材,而投身于新的战斗之中。