《战国BASARA》中活跃的武将们,在现代高中再次展开了激烈的战斗:前任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处分,学园内群雄割据,为争夺新会长之位成为乱世。足球社的王牌“真田幸村”、棒球部的王牌“伊达政宗”,高呼着团结就是力量的“德川家康”,矢志打倒家康的“石田三成”等人纷纷参战——这个混乱的学园,还会有明天吗?
半月关之事告一段落,谢怜受神武大帝君吾的传唤回天庭述职,却意外得知有神官在鬼市附近施法求救。而鬼市如今的主人“血雨探花”花城,正是七日前突然辞别的红衣少年三郎。此事疑点重重,谢怜自愿请命,与风师青玄、东方武神郎千秋一同秘访鬼市探查真相……