在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司！命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。 就是在这种情况下，在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。
魅惑众生的九尾狐狸？吸人精气的合欢树妖？道家妹子求双修，仙家女神表示滚远点。游走在这些危险分子中间可不是容易的事情。但为了世界和平，少年封夕豁出去啦！
因兴趣而开始做英雄的男人，埼玉。他通过3年的特训获得了无敌的力量，成为仅凭一击就能打倒任何敌人的英雄。他和偶然成为自己弟子的杰诺斯一起，开始在英雄协会正式展开英雄活动。在怪人发生率异常上升的同时，英雄协会想到大预言家皱巴巴婆婆留下的“地球完蛋了”的灾害的可能性，并准备开始研究对策。此时，对怪人感到憧憬的饿狼出现了。
“这个巨人无论在什么时代，都会为了追求自由而不断前进，为了自由而战。其名为——进击的巨人”
终于揭开了墙外的真相和巨人的真面目。至今为止，人类付出了太大的牺牲。尽管如此，他们还是必须继续前进。因为还没有亲眼看到墙外的大海，那是自由的象征。
——时光荏苒，距离第一次“超大型巨人”来袭已经过了6年。调查兵团毅然对玛利亚之墙进行壁外调查。“墙壁的另一边是大海，大海的另一边是自由。我一直这样相信着……”墙壁中的人类第一次到达了大海。
在无限延伸的水平线尽头是自由，还是……艾伦·耶格尔的故事，即将迎来新的局面。
