故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
巧克莉（松本真理香 配音）和香草（井端珠里 配音）是生活在魔界的两个活泼可爱的小魔女，她们其中的一人，将会成为下一任魔界女王，为此，两人之间展开了激烈的竞争。两个姑娘来到了人界，她们的任务是收集由人类心情凝结而成的结晶，数量更多着便能够赢得比赛获得女王的头衔。 巧克莉个性开朗热情，将对付人类看成是小菜一碟，谁知道人界和魔界大相径庭，反倒是有些内向害羞的香草更受欢迎。某日，巧克莉邂逅了名为皮耶尔（小西大树 配音）的少年，从来不知真爱为何的巧克莉坠入了情网，这也就意味着她即将失去她的魔女之心。不仅如此，邪恶的欧葛尔人企图统治人魔两界，它们将打击的目标首先放在了巧克莉和香草的身上。
