传奇黑客为拯救人类被系统AI追杀身死,意外成为异界第一宗门的宗主,但为了应对宗内全是卧底的局面和随身而来的系统危机,陈宁只想低调的再观望看看。但如锥处囊中,纵使他冷面无双心系世人,也是万花丛中过,朵朵都沾身,最后在系统代理人姜雀的帮助下,陈宁王霸之躯一抖,敌我双方纳头便拜!世界隐秘争先恐后对他打开,最终破解灭世危机。
夜晚,洛洛在家里玩电脑游戏,突然落雷击中大厦,洛洛被传送到一个陌生的世界里。醒来之后,洛洛发现自己竟呆在一个以他最喜欢的机战游戏作为背景的虚拟世界。过不多久,茫然的洛洛就遭到猛兽族黑铁兽的袭击,差点小命不保,幸好时光之城的大将霹雳火及时出现将他救下,才避过猛兽族的追杀。洛洛与霹雳火结识成为朋友了,命运滚轮的转动无法避免,机战世界开始书写新的章程。
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
伝説の竜の卵を求めてある街を訪れた尋海アリスは、ホラーに襲われそうになったところを、銀牙騎士ゼロこと涼邑零によって救われる。それ以来、零に興味を持ったアリスは彼に付きまとう。零はアリスをやり過ごしながらもこの街でホラーを討滅し続けていくが、やがて人間を憎悪する竜騎士エデルが復活したことから、竜を巡る戦いに巻き込まれることとなる。