西宁少年陈长生身患奇症活不过二十岁,为寻改命之法,前往神都参加大朝试,却因与真凤徐有容的一纸婚约,遭受打压,被流放进废弃的国教学院。陈长生凭借三千道藏,开启修行逆袭之旅,青藤宴废天海牙儿,未央宫胜神国七律,更是与伙伴唐三十六、落落、轩辕破奋战大朝试,夺得首榜首名,却得知改命之法难如登天。陷入迷茫的陈长生,在天书陵见证一代传奇荀梅陨落,激励他继续前行,在周园与魔族的战斗中,遇见乔装而来的徐有容,二人一路生死相依,联手挫败魔族阴谋,彼此相爱,却因周园崩塌分离。
由于两位假面骑士的活跃,邪恶组织·杰鲁修卡被消灭,但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动,而受到该邪恶组织的追杀,之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造,但二人知道改造人的悲哀,而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机,志郎舍命相救,被机关所伤而奄奄一息,为了救他一命,1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石头世界里,千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”,最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是,由灵长类最强的高中生狮子王司领导的“武装帝国”却步步为营。旨在净化人类的司试图通过使用强大的力量来阻止科学的发展。 科学 vs 武力的战斗经过激战,千空等人的科学王国占优势,之后两国终于和解。 由于同伴的谋反而处于冷休眠状态的司为了复活全人类,科学王国以石化光线的发生源、地球的背面·新世界作为目标! 冲出世界解开石化之谜!石头世界大航海时代终于开幕——‼
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