一部记录名侦探柯南和海东小子之间对抗的电影，包括用新的动画重拍海东小子首次亮相。
故事发生在1980年代的函馆，讲述热爱学校午餐的教师甘利田幸男，与同样热衷营养午餐的学生之间的趣味竞赛，他们展开一场「谁最享受学校午餐」的较量，除了美味的午餐对决，电影还穿插了甘利田老师、学生与周围成人的生活故事，充满幽默与怀旧气息。
怪盗基德的预告信出现在了北海道函馆，斧江财阀的收藏库中。这次基德将要盗走的是，江戸幕府时期新选组副长土方岁三的日本刀。向来追逐奢华宝石的怪盗基德，居然会看上刀？n此时，被称作西部名侦探的服部平次和柯南一行人，也因为剑道大会来到了函馆，在基德执行预告的当日，平次看穿了基德的伪装并对其穷追不舍！n同一时间，一具尸体在函馆仓库街被发现，尸体的胸口有一个十字伤口。搜查中，出现了一位被叫做“死之商人”的活跃于亚洲一带的美籍日裔军火商。这个人一直在寻找斧江家初代家主藏在函馆的宝藏。斧江家江戸幕府战争时代深耕军需产业，传说那宝藏是能扭转幕末纷争的强力武器，而这宝藏似乎和基德追逐欲盗取的刀有着千丝万缕的联系。在基德瞄准刀的同时，有一位剑士也在向基德逼近……
