滨海空港海关旅检一科科长郭聪带领张瑜、吕晓妍、言柏然等关员坚守海关一线，在长约五十米的海关出入境通道之内，识别并拦截各种走私分子。在基因样本走私案、《层峦时景图》走私案、HPV九价疫苗走私案、盔犀鸟头胄走私案等案件中，他们战胜了重重困难，揪出走私团伙幕后头目，保护了国家利益。郭聪、张瑜等新一代海关人也各自有了宝贵的收获，在并肩作战中迅速成长起来。
尘封的档案被翻开，紧张感扑面而来。当香港真实奇案成为故事蓝本，陈旧的案件是否能被揭开？在追踪线索的路上，能否突破困局，让真相大白于天下？
《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。 本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》，已有四部推出，部部故事悬念迭出，情节扣人心弦，《神探狄仁杰5》也即将在2014与观众见面。《神探狄仁杰》系列电视剧不仅融合扑朔迷离的悬疑剧情与恐怖的视觉元素为一身，更加入了李元芳与狄如燕的爱情、狄仁杰与曾泰的师生之情、以及武则天与狄仁杰的君臣际遇等情感戏码，使得本系列电视剧在惊险刺激的段段案件中增添了不少温情色彩。
知青方新颜和江海洋是一对情投意合的恋人，两人拥有共同的理想，双双被推荐去上大学。他们因一场误会分手，多年后重聚时，方新颜已经和善良忠厚的周新民结婚，两人放下往事的羁绊，在工作中精诚合作。周新民因病去世，江海洋这才得知当年令人唏嘘的往事。江海洋陪伴方新颜渡过难关，并担负起照顾周家人的责任。许林波是方新颜的同事也是追求者，因为私心走入歧途，不仅给工厂带来困扰，也把自己逼到困境。方新颜和江海洋力挽狂澜，帮助工厂和许林波摆脱困境。许林波幡然悔悟，也重拾对事业的初心。
