夜晚,洛洛在家里玩电脑游戏,突然落雷击中大厦,洛洛被传送到一个陌生的世界里。醒来之后,洛洛发现自己竟呆在一个以他最喜欢的机战游戏作为背景的虚拟世界。过不多久,茫然的洛洛就遭到猛兽族黑铁兽的袭击,差点小命不保,幸好时光之城的大将霹雳火及时出现将他救下,才避过猛兽族的追杀。洛洛与霹雳火结识成为朋友了,命运滚轮的转动无法避免,机战世界开始书写新的章程。
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。