从前有位“光之巨人”，他负责保卫世界和平，对抗巨型怪物和外星人入侵的威胁。他就是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联系，并在使命完成后离开了地球。时至今日，人类已进入了繁荣时代，但这只不过是和平的假象...现在，世界再次需要“光之巨人”的力量。就在这时，一个新的英雄出现了，他继承了光的基因。但是他并不高大，是一名中等身材、多愁善感的高中生，穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎，是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼，一个新的故事就此展开。
我开始能看见那个在意女孩的好感度了——。迟迟不敢向青梅竹马茉莉花告白、优柔寡断的北见彼方，对着流星许下了强烈的愿望。"希望能像恋爱游戏一样，看到对方的好感度啊~~~!!"结果从第二天开始，他的视野里就出现了浮现在班上女生们头顶的好感度计量表……!?虽然感到困惑，他还是怀着期待与不安确认了茉莉花酱的计量表，上面显示的，竟然是突破了底线、滴落着粘稠黑泥的坏掉了的好感度计量表——!?"茉莉花酱，明明讨厌我，为什么一直以来都对我那么温柔呢？"面对残酷的现实，他开始思考她至今为止言行背后的真相。究竟，"腹黑可爱"的茉莉花酱隐藏的真实想法是什么？她是真的讨厌主人公，还是计量表的显示藏着什么秘密？在计量表所指示的"地狱"尽头，等待着他们的真爱归宿究竟会是何方!?
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……
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