沉睡万年的辰南从神魔陵园醒来,在经历了一系列奇遇后名动四方。随着辰南来到央锦国遇到晨曦,新的冒险再次开启,在开元城大战、到死亡绝地寻找身世之谜、大战凌家只为求一个公正清明。在这一季,辰南会在探寻身世之谜的冒险当中不断搜寻雨馨的踪迹。
在不远的未来,地球迎来了一位神秘的天外来客——帕莫,它是宇宙智慧文明希尔人的运输飞船,携带着6400万年前消失的恐龙重归地球。希尔人在将恐龙带到地球的同时,也给人类带来了先进的基因技术,人类由此进
为获取参加天行号比赛的资格,星航、芸芸率超星车队来到西大陆,却在途中受到神秘人的袭击,损失惨重。虽然超星车队在西大陆当地人的帮助下,平安抵达绿洲城,但他们很快发现,西大陆的超竞速大奖赛早已停办多年!如果想要重启比赛,必须先通过天骄、天龙、隐风三大车队的考验,而原本约定见面的猪猪侠也不知所踪!面对这重重困难,超星车队还能够完成挑战、重启比赛吗……
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」,被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后,恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
由于两位假面骑士的活跃,邪恶组织·杰鲁修卡被消灭,但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动,而受到该邪恶组织的追杀,之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造,但二人知道改造人的悲哀,而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机,志郎舍命相救,被机关所伤而奄奄一息,为了救他一命,1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。