《海底小纵队第九季》讲述了一群可爱小动物组成的海底探险小队的故事。他们居住在神秘基地——章鱼堡，随时准备出发去解决海底、陆地、空中的险情、排除可能发生的危险。小纵队成员们以巴克队长为领导核心，集结呱唧、皮医生、达西西、章教授、西瓦、巴德等团队成员在全球各地完成“探险、拯救、保护”的使命。他们足智多谋，各怀绝技，齐心协力，时刻准备克服险情，排除危机，为各种各样真实存在的陆地及海洋生物提供帮助与救援。
童守町接连发生各种无法解释的怪异现象。为了保护孩子们，一位教师被派往童守小学赴任——他就是五年三班的班主任鵺野鳴介，通称“ぬ～べ～”。平时温柔又有点迷糊的他，其实拥有另一个身份：全日本唯一的灵能力教师
小猪佩奇已经五岁了，与她的猪妈妈，猪爸爸，和弟弟乔治生活在一起。佩奇最喜欢做的事情是玩游戏，打扮的漂漂亮亮，渡假，以及在小泥坑里快乐的跳上跳下和与好朋友苏西羊弟弟乔治一起玩儿，拜访她的猪爷爷，猪奶奶。故事内容多数环绕日常生活，比如小孩子们参加学前游戏小组、探访祖父母和表亲、在游乐场游玩、踏单车等等。
故事將圍繞綠谷出久與死柄木弔的對峙、轟焦凍與其兄轟燈矢了斷家族恩怨，以及麗日御茶子與渡我被身子的相遇展開，同時也將迎來歐爾麥特與「人人為我」的戰鬥結局。
