在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……
《进击的巨人第二季》是根据日本漫画家谏山创的漫画作品《进击的巨人》所改编的同名动画作品的第二季，讲述高墙内的人类们为了自己的生存对抗巨人的故事。动画由WIT STUDIO负责制作。 该作品延续第一部的残酷，继续这一场悲壮的史诗。 人类曾一度惨遭巨人捕食而崩溃，濒临灭绝。幸存下来的人们建造了三面巨大的防护墙来阻止了巨人的入侵，在这隔绝的环境里享受了一百年的和平。不过作为“和平”的代价，人类失去了到墙壁的外面的“自由”，如同圈养的畜牲一般，安稳地生活着。主人公艾伦·耶格尔对还没见过的墙外世界抱有兴趣，同时也对人类失去的 “自由”抱有向往，不同于惧怕巨人且盲目相信墙壁能保护自身安全，而甘愿生存在墙内的大多数人类，他极想到墙外的世界去探险，也因为这种想法，人皆视其为异端。 就在这悠长的安逸持续了一百年，也就是艾伦·耶格尔十岁那年之际，突然，一个前所未见、身高60米的“超大型巨人”出现在人类面前，他以压倒性的力量破坏了巨墙，其后瞬间消失，巨人们成群地冲进墙内，人类惨成饵食。 看到了人们、伙伴、母亲先后死在巨人口中，他怀着对巨人无以形容的恨意，誓言全歼巨人。母亲死亡、父亲失踪。其父可能掌握了巨人之谜，艾伦·耶格尔因父亲而获得了的“巨人之力”，在军队同期训练生里有着其他人无法比拟的强悍精神力，虽然见过地狱，依然敢于向巨人发起挑战，进而加入向往以久的调查军团，艾伦的生活，就在这一刻，开始发生了翻天覆地的变化……
