西历5012年。突然入侵地球的<外星人>与其制造的<机械生物>导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球,为了夺回地球,利用<人造人>士兵展开反攻作战。 然而无限增加的<机械生物>阻挡在前,战争陷入胶著状态。 作为最终兵器,人类派遣新型人造人<寄叶>部队至地球。刚被派往地球的<2B>与先行调查员<9S>会合,一同执行任务,却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战,无生命<人造人>的故事-- PS:Automata指的是“自动人形”,别再机械纪元求求了。
只会拍摄灵异照片的摄影师森丘耕平,为了取材来到了德国的古城堡,与吸血鬼少女叶月相遇了。在城里被幽禁的叶月,吸了耕平的血、想作为“仆人”逃出城里,可在耕平身上却没有一点效果。后来不知不觉的耕平破坏了城里的封印装置,与叶月成功的从城里逃了出来,为了寻求母亲的的行踪而来到了日本。到达了日本的叶月,来到了耕平与祖父一起居住的家,无理取闹般的和他们住在了一起。自小也失去了母亲的耕平,看到了叶月与自己的重叠,决定作为保护者保护叶月一起寻找母亲。