在都立杜鹃花台高中放学后的教室里,响裕太在笔记本上一遍又一遍的画着GRIDMAN。这个世界曾经被一个少女创造、又被破坏。拯救了那个少年的心的,是从异次元来的超级代理人GRIDMAN,少女制作了拥有心灵的怪兽,以及裕太他们。在和平的世界力生活的他们,日常生活随着一身声巨响开始崩溃。
当世界仍在从上一季的全球灾难中恢复之际,已发生变化的马克因内疚而痛苦不堪。他在全力保护家园和挚爱之人时,与一股强大的新威胁正面交锋,这股威胁足以永远改变人类的命运。