明朝严世藩（罗乐林）为排除异己杨继盛，遂派出豢养的杀手“十三死肖”往杨家斩草除根。杨家乃武林世家，十二死肖接连失手，藩最后唯有派出最厉害的第十三死肖“人”（钱小豪）执行任务。适盛之子云清（张兆辉）有事要赴武当，杨家无人能敌“人”之武功，惨遭灭门。当“人”手刃身怀六甲的杨家媳妇时，天刚正亮，就在此刻“人”发生极大变化！原来“人”只能于夜间杀人，天亮便复现人性。“人”在日出那瞬间杀人，良心发现痛不欲生，决背叛藩流浪江湖。藩恐“人”成后患，下令余下死肖追杀之。“人”幸得清仗义相助，得以歼灭所有死肖，清更不记旧仇助“人”解除毒咒回复常态。“人”为报答清，决以死赎前罪……
本剧讲述了天窗首领周子舒为求自由，不惜以生命为代价退出组织，命不久矣之际遇上一心灭世的鬼谷谷主温客行，两人因卷入江湖纷争相识相知，最终成为彼此救赎的故事。一场阴谋，两个知己，五块宝藏拼图，廿载恩怨，千百年江湖梦。
《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。 由“铁三角”张铁林、张国立、王刚主演的系列电视剧《铁齿铜牙纪晓岚》，至2009年已发行四部。作为该系列电视剧的第三部，本剧集不仅由这三位老戏骨继续联袂演绎，更在人物关系的设定上，邀请台湾笑星张庭出演神秘女子陆琳琅，为本剧增色不少。
在被董家豪截取了货物后，任天华（骆达华饰）开始怀疑达子（赵达饰）的身份，但这一切都无法挽回，当他打算找扎萨再次谈判时，却从邓敏（邢宇菲饰）口中得知自己的地盘已经被东带来的一批人所攻占，一时之间，华仔集团被抢占，任天华在邓敏的陪同下，来到阿四修养的民居里，却没想到邓敏举枪要杀自己，而与此同时，猜措带着一群警察也杀入，华仔彻底落魄。而董家豪集团在毫无防备之时，被扎萨的一群雇佣军攻占了豪宅，而达子因为被东放走，而免于在制毒基地被猜措抓住的危机。金三角的两大贩毒集团，一时之间都被扎萨利用猜措警长和雇佣军的力量而攻下，据为己用。落魄的两个毒枭在得知自己的势力都被扎萨所占有，这一切的遭遇都是扎萨所赐之后，曲经利用两人现在的情况，平息两人之间的对抗，并利用他们希望夺取势力的心态，从而使他们选择联手。达子和大陆在得到了曲经从上级哪里获取的指示后，决定利用任天华和董家豪为了夺取利益的想法，利用他们从而混进扎萨集团。而扎萨集团在夺取了任天华和董家豪的利益后，在金三角独霸一方，这也使得达子和大陆为了还金三角一片晴天的重任更加艰难
