该剧改编自清闲丫头所著同名小说。故事延续第一部的剧情，讲述三法司少年团联手“攘外”，将一个个看似毫无关联的案件抽丝剥茧、扎根串联，护百姓安宁，更守家国平安的故事。
本剧讲述二战期间1942-1945年澳门“孤岛”时期的抗战风云故事。1941年12月香港沦陷后，澳门成为各国战略物资中转交换的重要港口和国际情报中心，被推到风口浪尖。澳葡政府名为“中立”，实则任由日军泽荣作特务机关横行霸道。爱国华人何贤、马万祺以及中共地下党柯麟等人以强烈的爱国心与责任感团结同胞，凝聚起中华总商会、镜湖医院和同善堂等澳门华人社团力量奋力反抗。在危难时刻，他们发现只有中国共产党才能救中国，才能给中华民族带来全新的希望。澳门爱国华人和中国共产党同心同德与日本侵略者在金融战、情报战、物资战等各条阵线上斗智斗勇，取得一次次重大胜利。澳门的抗日救亡运动，不仅帮助澳门同胞渡过了澳门史上艰难的“风潮”岁月，同时筹集大量抗战物资和款项为支持全中国抗战和世界反法西斯战争作出了重要贡献。
九一八事变之后,抗日呼声日益高涨，苏海龙和黄显声打响了沈阳城抗击日寇的第一枪。在养父和亲人的相继离去后，苏海龙走出悲情，积极组建抗日队伍，与邓铁梅一道加入东北抗日革命军。在张婉婷的影响帮助下，苏海龙光荣地加入了中国共产党，带领部队给予日本关东军以沉痛的打击。日本关东军对苏海龙所在的部队进行了多次围剿。随着抗日斗争的形势逐渐严峻，东北抗联奉命相继进入苏联远东地区进行休整。苏海龙奉命前往延安抗大学习，学习结束后，苏海龙被派往苏联远东第88步兵旅。苏海龙多次率领小分队进入东北，对日本关东军进行渗透和侦查，成功炸毁虎头要塞号称“亚洲第一炮”的巨型榴弹炮，为日后的总攻扫清了障碍。
1992年，哈尔滨731陈列馆工作人员小金在整理史料时，发现这段历史的记录残缺不全，为寻找真相，他踏上了一场跨越数十年的跨国取证之旅，逐渐还原出那段被尘封的黑暗岁月真相。故事采取双时间线叙事，镜头回到日军侵华期间的哈尔滨，通过几个当事人的视角，深刻揭露日军731部队残酷的人体实验和泯灭人性的暴行，鞭笞日本军国主义的反人类本质，凸显中国人民坚韧的抗争精神。
屌丝少年林大鱼进入大学第一天就遇见了插班生美女“燃”，却不料燃女神声称自己是五十年后的林大鱼，从未来穿越而来，目的是为了拯救林大鱼。因为林大鱼原本的人生是迷恋校花颜子琳、遭到校霸曹天的打压、感情学业双双失败，最后从学校天台上失足摔落，还牵连了青梅竹马的发小土豆妹一起摔死了。随着燃女神对自己无所不知、对即将发生的事情未卜先知、展示出无所不能的超能力，林大鱼从不信、到相信、到拜师未来的自己：燃女神，林大鱼渐渐成为暗中拥有超能力的校园风云人物。 面对林大鱼的崛起，校霸曹天暗中使坏，摸清楚了燃女神的能量不可再生且有超级芯片这种东西的存在，校霸曹天指使女友颜子琳使美人计从林大鱼那获取情报，燃的能量用尽，自燃消失，林大鱼也终于知道了燃并不是未来的他，而是未来的土豆妹，一直爱着林大鱼的土豆妹，不甘心林大鱼的悲惨命运，穿越回来守护和拯救林大鱼，但改写命运何其难，饶是拥有超能力的燃从未来穿越到现在帮助林大鱼，林大鱼还是摔下天台，危难时刻，土豆妹选择了和燃女神一样的牺牲，最后关头救了林大鱼，土豆妹身亡。 明白了土豆妹对自己的真情，林大鱼借助燃留下的超级电脑，复制出了未来的虫洞仪器，穿越虫洞再次回到上大学的那一天，他又看到了可爱的土豆妹，也再次遇见从未来穿越而来的燃女神......
