骊城公安局最年轻的法医齐思哲（罗云熙 饰），因一场车祸失去了女友俞菲，但他发觉意外的背后似乎隐藏着神秘的幕后推手。为了调查真相，齐思哲入职成为河城市公安局的刑侦法医，却被迫卷入一桩桩令人细思极恐的奇诡悬案之中，身亡许久的被害者被重重蛛丝包裹，失踪的尸体出现在标本室的福尔马林中……在侦破过程中，他与祝青越（刘雅瑟 饰），韩烽（江奇霖 饰）强强联合，抽丝剥茧屡破奇案，而牵涉当年俞菲之死的“原钻”毒品案，也逐渐展露冰山一角……
明末清初，各路英雄纷纷组织团体反清复明，其时势力最庞大的有洪门及天地会，洪门传人洪熙官（石修饰）与天地会首脑姚璘（关海山饰）经常密谋活动，而洪熙官身上更有着一块先朝遗下，可以号召反清义士的金牌。 一次，洪熙官与洪门各长老商议复明大计时，清兵突然杀至，清廷并有深谙邪术的赤冠仙（郭锋饰）与徒弟赤练甲（杨炎棠饰）相助，洪门长老均被杀，洪熙官则逃出，躲进民间机房中充作小工。 先后遇上方世玉（董玮饰）及胡惠乾（苗侨伟饰） 其时，熙官行藏被清廷侦破，清廷欲在熙官手上夺取那面金牌，熙官之金牌却被世玉抢去。翠花知赤练甲厉害，要世玉投少林寺，一来避难，二来可学技艺，世玉虽不愿意，碍于母命难为，只得与惠乾上路。 天地会首脑姚璘亦想得到熙官的金牌，因此遣女儿姚冷翠（欧阳佩珊饰）上少林，冷翠是个心高气傲的少女，她上少林时惹下不少麻烦，但是因为世玉对她一见倾心，竭力相助，冷翠得以被少林寺收留。 世玉对冷翠虽则追求甚力，但是因为冷翠目的在熙官手上的金牌，对熙官更为接近，世玉与熙官便因此不合。 一日，惠乾家人突来报讯，说乾父被机房中人打死，乾亟欲下山为父报仇，与世玉、熙官施计共同打出木人巷，至于熙官，由于冷翠突然离去，亦下山赴天地会寻她。 途中，熙官助同门师弟周俊（杨家诺饰）去拆方咏春（黄杏秀饰）的二字钳阳马，成功之后，不料咏春誓言非熙官不嫁。另一方面，姚璘见世玉一表人才，意图收为己用，劝冷翠与世玉周旋，由于世玉一片痴心，熙官见此，决定割爱，而与咏春结合。 清廷力量以达少林，少林寺在戒空和尚（江毅饰）一役中，被夷为平地。熙官、世玉与惠乾三人在经历患难后，尽释前嫌，共同连手对付赤冠仙。
警员戴展硕（古天乐 饰）做事吊儿郎当，毫无责任感，使警犬Rocky十分鄙视，有灵性的Rocky故意处处刁难展硕。后来Rocky于一次行动中受重伤而不得再工作，展硕于心不忍，决定收养Rocky。 硕仔的邻居阿文（宣萱 饰）也是爱狗之人，却与展硕水火不容，阿文更认定是因为Rocky的关系让自己的爱犬东东失踪了。自来狗豆豆的出现慰藉了阿文的心灵。但Rocky与豆豆很快坠入了爱河，使身为主人的展硕与阿文十分头疼。阿文的好友子珊（郑秀文 饰）是展硕的房东，因为阿文的关系，与展硕之间的关系并不是很融洽。但在子珊失业失恋后，得到展硕的鼓励，两人不知不觉爱上了对方。 此间展硕的上司小敏（李珊珊 饰）对展硕也有了好感，令恋爱中的展硕十分苦恼。得知好友铁男（林晓峰 饰）喜欢小敏时，展硕极力鼓励铁男进行追求。 子珊是个事业心重的女孩，后来跟展硕分手了也是因为工作的原因。展硕在子珊离开香港进修后，与阿文共同研究宠物经验而日久生情。子珊学成归来，阿文无意中发现子珊对展硕余情未了，感觉自己抢了自己好友的男友，内心矛盾……
毛小方（林正英 饰）和七姊妹堂堂主钟君（苑琼丹 饰）之间的矛盾由来已久人尽皆知，然而，钟君的弟弟钟邦（王书麒 饰）实则五世奇人，毛小方得知此时后十分想要收他为徒。一次偶然中，毛小方结识了名为杨飞云（徐少强 饰）的男子，两人相见恨晚，相谈甚欢，很快便成为了好友。 令毛小方没有想到的是，杨飞云人面兽心，他设计陷害毛小方，使得毛小方与钟邦反目成仇。就在毛小方最失落的时候，是钟君一直陪伴在他身旁，两人之间的矛盾和误会烟消云散。杨飞云和僵尸王（李道洪 饰）同流合污，企图祸害人间，毛小方决心阻止此事，一场大战即将拉开序幕。
欧阳海潮（温碧霞）自幼生活在育幼院，多年来，她的助养人Uncle Rain一直是她认知外面世界的窗口，不间断的通信令两人建立了深厚的感情，遗憾在缘悭一面。踏入社会的海潮与失散多年的母亲（罗兰）重逢，得知自己的悲惨身世，决定向迫使她家破人亡的乔永发（黄伟）报仇，而目睹母亲被欲斩草除根的乔永发杀害后，她更加重了复仇的念头。 海潮忍痛与相恋多年的男友方有为（尹杨明）分手，又一改清纯形象变作成熟性感女郎，自造机会结识为人阴险的乔家三公子乔力（罗嘉良），两人很快打得火热，期间心情，她化为文字向Uncle Rain倾诉，只是信件均未寄出，她不知Uncle Rain就是乔家性情温良的二公子乔立（温兆伦）。而乔立将海潮认出时，数次欲将身份挑明总不得机会。其后海潮命运多舛，她与乔立的情感也浮浮沉沉。
本剧改编自豆瓣阅读连载小说《棕眼之谜》 ，作者九介先生。推理视频博主杨正辉发现前女友刘薇失踪许久，而这似乎与一位名叫曾杰的陶艺家有关。一年前曾杰工作室的火灾掩盖了关于刘薇的秘密，如今的曾杰竟又在谋划杀妻夺财。随着杨正辉的调查，“真相背后的逻辑”渐渐显现…
