拥有着7000年历史的萨格大陆继续风起云涌。立志要做最伟大魔晶猎人的小裁缝千瑞,在魔晶学院不断卷入阴谋的漩涡。一步步接近真相的代价竟然是要牺牲自己无比信任的朋友和恩师!徘徊在绝望中的千瑞和他的伙伴们到底该何去何从。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」,被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。在社会获得显著发展的背后,恐怖的怪物出现了。吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。