因一场车祸齐思哲失去了女友俞菲，但他发觉意外背后另有隐情。为调查真相，齐思哲入职成为河城市公安局的刑侦法医，却被迫卷入一桩桩奇诡悬案之中。在侦破过程中，他与祝青越、韩烽抽丝剥茧屡破奇案，而牵涉当年俞菲之死的“原钻”案，也逐渐展露冰山一角。
在第二部里，包拯（陆毅 饰）已经褪去了初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，而成了稳重有担待的县城父母官，偏安一隅为民请命。这天收到皇上急召回京，查办收受贿赂贪污的官员接连连续死亡的案件。少年包青天再次出动，而沿路上在各个案件里遇见的王朝马汉、张龙赵虎，日后都会是我们熟悉的大名鼎鼎的包公身边的护卫人物。公孙策（任泉 饰）已然拜服在包拯的聪明才智下，甘愿辅佐他办案。这次遇见的姑娘的是惯偷小蜻蜓（范冰冰 饰），活泼捣蛋的她一直身份神秘，直到案件去到大画家冯止水事件，大家才明白小蜻蜓的身世悲惨：收养她的义父自小视他如己出，为她亲笔作画《牡丹亭上的少女》，内藏一秘密。后来失踪于江湖再无音信，多年来小蜻蜓用尽办法找寻义父下落皆无消息，这次唯有希望包拯能查出事情真相。
菊池泉（松本真理香 饰）是年过三十依然单身的出版社小编辑，总是独来独往的她其实内心里非常的渴望婚姻和家庭，只是，那个对的人似乎暂时不会出现。小泉的职业梦想是可以依靠贩卖文字维生，并且只写自己想写的东西，而这个梦想现在似乎也离她非常遥远。 在职业和感情上都处于瓶颈期的小泉，在一次偶然中遇见了名叫中岛春子（大地真央 饰）的女人。春子是衔着金汤匙出生的千金大小姐，经历过一次失败的婚姻，如今又身陷另一段糟糕的关系里。虽然春子已经60岁了，但她风风火火的个性和一张不怕得罪任何人的嘴令性格内敛温和的小泉对她产生了崇拜之情。
半平太（锦户亮 饰）被逼自尽后竟然穿越到了现代，在经历了一连串宛如灾难一般的意外后，半平太遇见了善良的老人佐伯真人（森本里奥 饰）。佐伯经营着一间补习班，他不仅收留了无处可去的半平太，还任命他成为了补习班的临时老师。 佐伯的孙女晴香（比嘉爱未 饰）对于半平太的真实身份十分怀疑，充满了戒备。之后，半平太遇见了在他之前穿越过来的坂本龙马（神木隆之介 饰），两人联手寻找回到过去的方法。随着时间的推移，半平太和佐伯一家人之间产生了深深的羁绊，半平太利用着战场上的经验，解决了身边发生的一个又一个难题，获得了孩子们的喜爱与信任。
