在第二部里，包拯（陆毅 饰）已经褪去了初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，而成了稳重有担待的县城父母官，偏安一隅为民请命。这天收到皇上急召回京，查办收受贿赂贪污的官员接连连续死亡的案件。少年包青天再次出动，而沿路上在各个案件里遇见的王朝马汉、张龙赵虎，日后都会是我们熟悉的大名鼎鼎的包公身边的护卫人物。公孙策（任泉 饰）已然拜服在包拯的聪明才智下，甘愿辅佐他办案。这次遇见的姑娘的是惯偷小蜻蜓（范冰冰 饰），活泼捣蛋的她一直身份神秘，直到案件去到大画家冯止水事件，大家才明白小蜻蜓的身世悲惨：收养她的义父自小视他如己出，为她亲笔作画《牡丹亭上的少女》，内藏一秘密。后来失踪于江湖再无音信，多年来小蜻蜓用尽办法找寻义父下落皆无消息，这次唯有希望包拯能查出事情真相。
戴顾东（夏雨 饰）经营的茶餐厅受金融风暴牵连陷入财困，急需资金周转，不知内情的叶慕升（许绍雄 饰）觊觎茶餐厅的铺位主动入股，顾东暂得援兵便埋头研制新菜式，谁料新请回来的散工崔喜喜（商天娥 饰）炒了一碟蛋炒饭，深受米芝莲代表赏识，顾东对她宠爱有加。 一天，银行代表利蓉姿（伍咏薇 饰）突然出现，喜喜因迷债事件与她大打出手，喜喜受伤失忆，顾东为保米芝莲星级声誉，安排所有人假装为喜喜的家人，自己是喜喜的大哥，慕升是丈夫，儿子是大提琴教师叶积良（陈键锋 饰），就连女儿戴莹莉（唐诗咏 饰）也被迫由积良的女朋友变做表妹，关系乱七八糟，惹来连番笑话……麻烦事一浪接一浪，被银行辞退的蓉姿突然声称自己是茶餐厅的股东，要为茶餐厅作大改革；一家本来平凡不过的港式茶餐厅，突然三权分立，人人各怀鬼胎……
铁马新马仔陈志新（罗嘉良）刚调任到李sir的小组，但为同僚眼镜仔所排挤。新马仔因周英奇飞车撞死人案件而结识记者张紫蕙（刘秀萍），两人即坠入爱河，紫蕙大哥张锦辉（李龙基）乃计程车司机，对铁马极度憎恶，加以阻止两人恋情.. 小飞侠-何国昌（尹阳明）为人正直，为瓦解飞车集团，竟出卖好友Joe（王书麒）。後偶遇一富商之情妇Angel（李婉华），两人瞬即相恋，但Angel基於生活所求，进退两难。 皇家铁马一共有13集 主题 1 铁骑雄风 2 飞车女之吻 3 马路狂徒 4 的士大哥 5 铁马俏佳人 6 运油风暴 7 阿宝 8 顶爷 9 死亡边缘人 10 铁骑豪情 11 回到学堂 12 光荣何价 13 严正法纪
谢颖之的离开让张伟杰（梁朝伟 饰）深受打击，封闭起了内心，不愿意再结识新的伴侣。期间，叔父张竟成（周润发 饰）从大陆来到香港，叔侄两人之间建立起了深厚的友谊。一次偶然中，张伟杰认识了名为巧宣（曾华倩 饰）的女孩，巧宣的温柔和善良融化了张伟杰内心的坚冰，两人渐渐走到一起，最终携手步入了婚姻的殿堂。 然而，随着时间的推移，最初热切的激情慢慢冷却，久而久之，张伟杰竟然和巧宣的好友吴欣产生了一段不道德的恋情。在一宗谋杀案里，吴欣不幸的成为了受害者死于非命，这起案件将巧宣和张伟杰也牵扯了进去。
程琛（苗侨伟 饰）虽然长得人高马大身强体壮，在家里却是个“妻管严”。他的妻子高励心（张可颐 饰）是个标准的女强人，天性多疑的她自打结婚以来就一直怀疑的看起来不怎么“老实”的丈夫，两人的生活中诸多的碰撞和摩擦，为此，程琛那自觉“万花从中过片叶不沾身”的弟弟程义（谢天华 饰）没少嘲笑自己没出息的哥哥。 一次意外中，高励心果真撞破了程琛的“奸情”，自尊心强又好面子的她在悲愤交加之际提出了离婚。就在这个节骨眼上，程义也遇到了自己的“爱情宿敌”，那时名为缪灵芝（李绮红 饰）的美丽女子，两个男人同时站到了人生的十字路口上，在欢笑和泪水之中，他们会做出怎样的选择呢？
