《TOKYO AIRPORT～东京空港管制保安部～》为去年富士卫星电视剧集《TOKYO CONTROL 东京航空交通管制部》的续篇。 故事设定为上一集的两年后，原为航空公司地勤人员的篠田香织（深田恭子 饰）一念之起辞职，参加国家考试并完成了航空保安大学严格的进修，最后终于成为独当一面的航空管制官被分配到羽田机场管制部。充满了紧张、兴奋以及不安的她登上管制塔，在那的是一群即使面对紧急情况也能冷静对应的保护人命的专业人员，他们每一个人都有着独特的个性。筱田与资历丰富的在职培训管制官竹内裕美（濑户朝香 饰）一同执行航空管制，但因为疏忽而造成的错误，筱田差一点引起事故。镇定地注视着筱田的队友们没有人责怪她的错误，这反而让筱田更加内疚。然而在筱田听说让自己成为结城升（时任三郎 饰）和近藤幸宏（要润 饰）的管制官的想法后，她很快振作了起来。这一次，篠田会成为一个合格的航空管制官吗？
在美国FBI研习期间，来自日本的音无月子（长泽雅美 饰）名声大震，荣登时代周刊头条，还与美国总统亲切会晤。与之形成鲜明对比的，则是月子的老上司警视厅搜查一课刑警丹内市生（竹中直人 饰）得到了丹内组解散的通知。沮丧的丹内从荣升警视总监的武重治（伊武雅刀 饰）口中得知，他有幸受总监直接领导，还没等他高兴多久，却发现自己被分在新成立的非科学事件搜查小组（UIU）担任组长，而这个小组正是在载誉回国后的月子拜托总监成立的。在此之后，丹内、柴山俊也（平山浩行 饰）、擅长电脑网络的滨中彩乃相继报到，此外还少不了追求月子的警视厅鉴识课警员胜浦洋人（沟端淳平 饰）。 富士山树民、外星人、鬼娃娃花子、三亿日元劫案，各种各样有趣诡异的都市传说和奇怪案件接连发生，顽皮的月子和伙伴们再度登场……
