故事发生在一个惟权力与力量至上的江湖中，讲述了多年前，中州的宗帅、北地的完颜藏和南疆的文太极三人争霸天下，因各家损失惨重，便立下二十年休战盟约。眼下二十年之约将至，一轮新的征伐正在暗潮涌动。三家互相猜忌仇视，各自立下“追血令” ，将敌对家族最重要的人物列于名单之上，发誓杀尽对方所有高手，一场惊心动魄的天下大战就此拉开了帷幕！
作为系列最终章的本次剧场版，将描绘挑战世界的遥等人。主角一行人所前往的新舞台，是过去曾经造访过的雪梨。在展开旅途之前的休息期间，遥偶然遇上了与曾在日本选拔大会中对战的选手，并展现了自己的斗志。而在雪梨的大赛中，来自各方的选手们将展开激烈的竞争。
故事发生在一间大超市之中，在陈列在此的商品间，流传着一个古老的传说，某一日，那位名为“顾客”的上帝会现身此处，把你带回家，从此你将登上人生的巅峰，享受无上的荣光。香肠弗兰克（塞斯·罗根 Seth Rogen 配音）和他的女友热狗面包布兰达（克里斯汀·韦格 Kristen Wiig 配音）最大的愿望，就是能被同一位顾客买回家，这样方可以过上向往已久的“合体”生活。 然而，一瓶曾经被顾客买走之后又被退回超市的蜂蜜芥末（丹尼·麦克布耐德 Danny McBride 配音）却道出了事件的真相，那就是，根本不存在什么上帝，也并没有天堂，等待着它们的，有的只有残忍的生吞活剥，骨肉分离。为了验证蜂蜜芥末的话，弗兰克找到了神秘的龙舌兰酒（比尔·哈德尔 Bill Hader 配音），与此同时，因为意外而跌落货架滚至别处的布兰达亦和同样遭遇的贝果萨米（爱德华·诺顿 Edward Norton 配音）、亚美尼亚薄饼拉瓦西（大卫·克鲁霍尔特兹 David Krumholtz 配音）一起，寻找回家的路。
柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
