為迎接機動戰士鋼彈SEED十周年的2012年，官方於2011年8月26日啟動「HD Remaster Project（高畫質再製企劃）」，畫面尺寸比將從原先的4：3升級為16：9寬螢幕，線性PCM音源化，部分音樂採用混音版，局部畫面的替換和修正，各特效與背景的處理變更，並整合特別版三部作以及「DESTINY」的賽璐珞片，再編輯為全48話，收錄至Blu-ray共四卷BOX販售。相較於過去其他鋼彈作品的Remaster僅是單純的高畫質化，本作有著更全面的提升。「機動戰士鋼彈SEED HD」於2011年12月23日起在BandaiChannel針對日本國內進行限定放送，TV方面則於2012年1月1日起在日本BS11播映。gundam.info同時提供附有簡體中文(已不再提供)、繁體中文、英文和韓文字幕影片的網路配信。愛奇藝將本作命名為「機動戰士高達SEED HD Remaster」於2011年12月23日11時起播出。
在大气磅礴的奇幻世界里，主角方寒如何凭借一己之力纵横天地之间。靠着一股不服输的倔强突破神通的奥秘，将肉身锻成永生之躯。无穷无尽的新奇法宝，崭新的仙魔凡三界盛世将由主角依次开启。将带你感受仙教魔门，人魔妖神，王皇帝君的奇幻风采。主角也将经历人间的爱恨情仇、恩怨纠葛，以及仙魔的斗法争端。最终带领你一起走上巅峰王者之路。
第1集：图图设计大师 第2集：掩耳盗铃 第3集：万能创可贴 第4集：又好又坏的广告 第5集：输了赢了 第6集：购物真方便 第7集：爸爸爱摄影（上） 第8集：爸爸爱摄影（下） 第9集：写一封信 第10集：宰相肚子装什么 第11集：我有多爱你 第12集：回来吧大智 第13集：没有玩具怎么玩（上） 第14集：没有玩具怎么玩（下） 第15集：好事还是坏事 第16集：每个人的弱点 第17集：别人难过的时候 第18集：答非所问 第19集：爸爸妈妈别吵架 第20集：妈妈的节日 第21集：讨厌的选择题 第22集：我有一双亮眼睛 第23集：那个龙猫 第24集：免费礼券 第25集：壮壮哥哥的兴趣 第26集：当我还是一个小宝宝
东京街头，数具男性尸体被发现，这是一场由“喰种”引发的大骚乱。大学生金木研（花江夏树 配音）原以为这一切离自己很遥远，直到一个夜里，他被自己心爱的女生袭击，原来她竟是以人肉为食的喰种。生命垂危的金木通过器官移植手术，才得以侥幸存活。而移植到金木体内的器官，来源竟然是喰种。 痊愈后，金木发现自己的身体有了某种奇怪的变化，他的一只眼睛出现喰种反应，而且他再也无法进食正常人的食物。让他感到可怕的是，他开始觉得“人类”才是满足自己食欲的对象。曾经只是一个普通人类的金木，难道从此走上狩猎人类、吞食尸体的喰种之路？
