千年前，神将飞蓬与魔尊重楼于新仙界中大战，神剑“照胆”跌落人间，飞蓬被贬下凡。千年后，蜀山锁妖塔震荡，获得魔剑的飞蓬转世——景天，与唐雪见、徐长卿及紫萱几人开始了一场为收集五灵珠封印锁妖塔的冒险。
令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
“这个巨人无论在什么时代，都会为了追求自由而不断前进，为了自由而战。其名为——进击的巨人”
终于揭开了墙外的真相和巨人的真面目。至今为止，人类付出了太大的牺牲。尽管如此，他们还是必须继续前进。因为还没有亲眼看到墙外的大海，那是自由的象征。
——时光荏苒，距离第一次“超大型巨人”来袭已经过了6年。调查兵团毅然对玛利亚之墙进行壁外调查。“墙壁的另一边是大海，大海的另一边是自由。我一直这样相信着……”墙壁中的人类第一次到达了大海。
在无限延伸的水平线尽头是自由，还是……艾伦·耶格尔的故事，即将迎来新的局面。
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自世界各地出现连接异次元与现实世界的通路「传送门」，已过了十多年。觉醒了特殊能力，被称为「猎人」的人们，与存在于传送门里地下城内的魔兽不断厮杀。猎人的能力在觉醒后就不再有成长空间，其等级也不会再有变化。然而，被称作是人类最弱兵器的程肖宇，在一次双重地下城的突击任务中得到了只有自己能够「升级」的能力，得以在战斗中不断变强。顺利通过转职任务，得到能操纵暗影士兵的职业「暗影君主」的肖宇，为了取得或许能医治母亲病情的道具「生命神水」的素材，而投身于新的战斗之中。
