人头攒动、过往喧嚣的地铁站，一名衣衫褴褛的男子及其沉重的行李箱引起安检人员的警惕。经过一番追逐，男子声称行李箱内有炸弹，旋即引起莫大骚动。等到防暴警察赶来将其制服，却发现箱子内居然蜷缩着一具尸体。被捕男子名叫张超（宁理 饰），是江潭市小有名气的律师。他起先对罪行供认不讳，但随后拿出不在场证明当庭翻供。为此，经验丰富的刑警严良（廖凡 饰）火速加入专案组。未几，《江潭晚报》女记者张晓倩收到匿名信件，寄信人声称要玩一场关系本案的九宫格游戏。一时间，案情变得扑朔迷离，而随着调查的深入，严良也发现该案居然与多年前的一起案件息息相关…… 本片根据紫金陈的小说《长夜难明》改编。
故事发生在民国初期，廖思成（刘小锋 饰）和方天翼（张若昀 饰）是富商顾汉森收养的义子，两人和顾汉森的亲生女儿顾婷（吴婷 饰）一同长大，彼此之间情谊十分深厚。从黄埔军校毕业之后，廖思成前往日本深造，在此期间，他邂逅了美丽的日本女子大岛由美（章雯淇 饰），两人相知相恋，无奈九一八事变爆发，廖思成告别了爱人，回到了祖国。 那一边，勇敢聪慧的方天翼深受戴笠（吴秀波 饰）的喜爱和信赖，戴笠赋予了他“黑狐”的代号，隐藏在此假面之下，方天翼在顾婷和同僚俞梅（李曼 饰）的帮助下，同日本人和汉奸斗智斗勇，可实际上，俞梅和廖思成一样，是隶属于中国共产党的地下党员。
