自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
时间是西元2040年。罹患罕见疾病的青年·怜人,在与青梅竹马绘理沙相约再会之后接受了冷冻睡眠治疗。过了5年后,怜人醒来之后等待他的却是全世界99.9%的男性皆感染病毒而死,现存50亿人口大多为女性的世界。近未来情色悬疑物语就此开幕。
电影讲述了一个将月球炸掉7成、并扬言一年后将要毁灭地球的不明生物杀老师,担任全校最不被看好的班级3年E班的导师,与学生之间发生的故事。杀老师虽然是个有马赫级神速移动能力、以及奇怪触手的生物,却为学生竭尽心力、赴汤蹈火。使得本来弥漫诡异氛围的课堂,却成为3年E班终生难忘的回忆。而3年E班的同学们与杀老师以羁绊和真挚互动所守护的约定,也陪伴着他们到了7年后的未来。
青虫怪利用监视蔬菜精灵的办法偷窥到了很多蔬菜精灵们的秘密,在得意之下他大肆宣扬,放了个大喇叭对着蔬菜园,循环播放自己观察到的秘密嘲笑蔬菜精灵们,蔬菜精灵们很生气,觉得自己的隐私被侵犯了,大家决定主动出击去找青虫怪算账。没过几天,蔬菜精灵们造出了一个空中播放器,他们要以欺人之道还治欺人之身,收集了青虫怪的癖好和隐私在空中播放,而且还会随着导航向其它的青虫居住地飞行,让青虫怪也尝尝隐私被人侵犯的滋味。青虫怪即恼怒又无可奈何,只好躲在贪吃府不出门,蔬菜园又可以维持一段时间的平静了