由于两年前揭发同僚贪污，台北警官黄火土（梁家辉）被上级报复调入冷门的外事组工作，利益也曾连带受损的新同事对他怒言相向，加上妻子清芳（刘若英）受不了他长期不回家要求离婚，黄火土感觉他的世界正在逐渐四分五裂。就在此时，三宗受害者的身份并无关联的震惊了台湾社会的离奇命案发生，法医（杨贵媚）验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌产生幻觉而死，因为缺乏此方面的人才，当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特（David Morse）协助破案，黄火土重被任用。随着一桩令所有人都目瞪口呆的事实的被发现，一场围绕政治利益与民众利益的斗争也在黄火土和办案伙伴李丰博（戴立忍）及整个警察队伍之间展开。
浩哥因欠了赵地主的粮食还不上遭到威胁，不得已带着三个兄弟到日军仓库偷了军粮。赵地主认得是日本军粮不敢收，土匪孙大脑袋心眼多不想买，浩哥只好拿回家吃，他的相好小寡妇发现是日本军粮后劝说浩哥归还。时机不巧，日本人已经因为丢粮加强戒备，而原路返回时袋子漏米撒了一路，日本人天亮后顺着痕迹找来将几人绑走。在刑场，浩哥遇见效仿他们偷军粮被抓的孙二。正当几人人要被日军处决时，国际记者正好路过，浩哥不但阴差阳错逃过一劫，还当上了中日友好督察队队长。一边的孙二就没有这个好命，被日本人偷偷枪毙。风生水起的浩哥转眼被扣上汉奸走狗的恶名，被全村人唾骂。浩哥意识到自己被所谓“中日友好”的幌子耍了，已经和全村人形同陌路。他一怒之下联手孙大脑袋手刃日本小队长，给孙二报仇，也扭转了名声。日本人火了，直接屠了二龙湖村。浩哥带着兄弟们与日本人进行了惨烈的殊死搏斗。最终，浩哥在日军仓库与日本大队长同归于尽。
