邪电王国的希拉博士因为妒忌人类的超文明,于是向地球进行连串破坏行动。久保田博士下令健太、耕一祈、瞬、千里和杏子变身成电磁战队百万连者,进行对抗邪电的行动。其后,更出现了第六位战士早川裕作,起初新战士不太喜欢电磁战队,后来相处日子越多,感情越深厚。希拉更控制王者魔兽,打算与电磁战队同归于尽。
进到宝石盒子里的叶罗丽战士们能打破记忆封印吗?浮云楼仙境银行里有什么秘密?被困在镜中世界的金王子,齐娜、菲灵、莫纱、荒石,又会如何呢?火领主自由了吗?辛灵仙子会复活吗?又会发生什么新的奇遇呢?黑衣人到底是谁?女王的真实目的是什么?灵公主为什么囚禁火领主?人类世界会和平吗?