自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
为获取参加天行号比赛的资格,星航、芸芸率超星车队来到西大陆,却在途中受到神秘人的袭击,损失惨重。虽然超星车队在西大陆当地人的帮助下,平安抵达绿洲城,但他们很快发现,西大陆的超竞速大奖赛早已停办多年!如果想要重启比赛,必须先通过天骄、天龙、隐风三大车队的考验,而原本约定见面的猪猪侠也不知所踪!面对这重重困难,超星车队还能够完成挑战、重启比赛吗……
南光太郎和秋月信彦在一个日食的日子出生、并且以兄弟的身份被扶养长大。信彦的父亲,秋月总一郎是秘密组织戈鲁戈姆的成员之一。在光太郎和信彦19岁生日那天,两人被这个秘密组织捉去改造成为戈鲁戈姆的支配者·创世王的候补者·世纪王。世纪王·黑日必须和世纪王·影月进行赌上性命的战斗,胜者就可以成为新一任的世纪王。但是被改造成为黑日的光太郎在秋月总一郎的帮助下,成功在脑改造手术前逃脱出来。此后光太郎成为假面骑士Black,为了保护日本,救出信彦而与戈鲁戈姆对抗。但是信彦却在被救出之前就变成世纪王·影月,于是光太郎不得不与他唯一的亲友信彦进行宿命的战斗。