毛小方（林正英 饰）和七姊妹堂堂主钟君（苑琼丹 饰）之间的矛盾由来已久人尽皆知，然而，钟君的弟弟钟邦（王书麒 饰）实则五世奇人，毛小方得知此时后十分想要收他为徒。一次偶然中，毛小方结识了名为杨飞云（徐少强 饰）的男子，两人相见恨晚，相谈甚欢，很快便成为了好友。 令毛小方没有想到的是，杨飞云人面兽心，他设计陷害毛小方，使得毛小方与钟邦反目成仇。就在毛小方最失落的时候，是钟君一直陪伴在他身旁，两人之间的矛盾和误会烟消云散。杨飞云和僵尸王（李道洪 饰）同流合污，企图祸害人间，毛小方决心阻止此事，一场大战即将拉开序幕。
该剧改编自清闲丫头所著同名小说。故事延续第一部的剧情，讲述三法司少年团联手“攘外”，将一个个看似毫无关联的案件抽丝剥茧、扎根串联，护百姓安宁，更守家国平安的故事。
曲向南（焦恩俊 饰）是全胜道馆的掌门人，然而，在一场十分重要的国际比赛中，曲向南被诬陷使用了兴奋剂，不仅被取消了比赛资格，更沦落认为了人人唾弃的无名小卒。戚百草（胡冰卿 饰）是曲向南的养女，在曲向南变成“过街老鼠”之时，只有戚百草坚定的相信父亲的清白，并为了证明清白而不断的努力着。 十六岁那年，在好友范晓萤（谭松韵 饰）的牵线搭桥之下，戚百草进入了松柏道馆练习武道，并在此结识了若白（杨洋 饰）和喻初原（白敬亭 饰）等好友，在同贤武道馆的对手的切磋和比试之中，几人之间结下了坚实的友谊。在相处的过程中，戚百草和外冷内热的喻初原渐渐走到了一起，这让一直暗恋喻初原的方婷宜（赵圆瑗 饰）十分恼火。
段天涯（李亚鹏 饰），归海一刀（霍建华 饰），上官海棠（叶璇 饰），成是非（郭晋安 饰）是护龙山庄的四大密探，各自有着江湖众人无法匹及的绝技，效命于神侯朱无视（刘松仁 饰）。此时因正德皇帝(邓超 饰)痴傻，政局混乱，东厂趁乱把持朝政，迫害忠良。权倾朝野的东厂太监总管曹正淳(李建义 饰)更是仗势欺人，处处与护龙山庄为敌。正在四人深陷于儿女情长和身世经历之时，当前形势急剧恶化，一件又一件命案直指护龙山庄，无形的阴谋笼罩着护龙山庄，神侯更是因为被奸人诬陷锒铛入狱。而神侯此时趁机设局假死，在四大密探联手合作下将曹正淳一伙连根除去。原本以为阴谋就此结束的四人此时却发现，原来皇帝的痴傻实为伪装，而身边最大的阴谋家正是养育他们长大，却窥探皇位二十多年的神侯！
在唐武德九年，李长歌（迪丽热巴 饰），原太子之女，在内廷政变中幸存并逃脱。逃亡过程中，她遇到了化名秦准的草原部落特勤阿诗勒隼（吴磊 饰），两人最初对立，随后逐渐建立了互相的尊重。在幽州，长歌揭露了一个阴谋，但身份暴露，被迫前往㮶州寻求庇护。在㮶州，她隐匿在刺史公孙恒的身边，帮助抵抗草原势力的侵袭，却发现隼竟是她曾经的熟人秦准，这让她感到震惊和痛苦。 面对㮶州的紧急情况，长歌决定成为战俘，前往草原与敌方谈判，从中揭露出大可汗的阴谋。为了保护大唐，长歌愿意暂时放下个人仇恨，拼尽全力解决危机。尽管隼为了救她与大可汗对立，两人却因为误会被迫分开。经历了许多波折后，长歌明白了仁者无敌的真谛，并最终发现前隋势力是背后真正的操控者。她与隼联手，为大唐和草原的和平做出了巨大贡献，并终于认识到彼此的真实感情，共同面对危机。
