自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
在不远的未来,地球迎来了一位神秘的天外来客——帕莫,它是宇宙智慧文明希尔人的运输飞船,携带着6400万年前消失的恐龙重归地球。希尔人在将恐龙带到地球的同时,也给人类带来了先进的基因技术,人类由此进
在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量,竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司!命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。 就是在这种情况下,在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识,慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。
大山武(前野智昭 配音)即将进入天日学园就读,在这所由女子学校改制而来的综合学校中,由其喜爱女孩子胸部的大山感到如鱼得水。在天日学园里,除了每天要学习的文化课程外,同学们还要学习掌握运用“元素”的技巧,其中格外有天赋者,则能够获得试用“魔具”作为武器的特殊能力。 个性傲娇的青梅竹马天谷春恋(下屋则子 配音),率真坦诚的栉八稻穗(野水伊织 配音),桀骜跋扈的姬神木灵(矢作纱友里 配音),在繁忙又惊险的学习生活中,大山和这些可爱的女孩子们之间产生了坚实的友谊。而随着能力的逐渐提升,大山发现,他们似乎被卷入了一场声势浩大的战争之中。