第二季的故事发生在第一季结束八年后，军情六处的特工乔纳森·派恩（汤姆·希德勒斯顿 饰）以为自己彻底埋葬了过去，如今他的化名叫作亚历克斯·古德温，在伦敦负责主导一个秘密监视小组，生活平静安逸。然而某晚，他偶然瞥见一位过去受雇于理查德的佣兵，并促使他再次行动，与哥伦比亚商人泰迪·多斯·桑托斯（迭戈·卡尔瓦 饰）发生冲突。在这段危机四伏的新旅程中，派恩结识女商人罗克萨娜·博拉诺斯（卡米拉·莫罗 饰），她勉为其难帮助派恩潜入泰迪在哥伦比亚的军火行动。抵达哥伦比亚后，派恩深陷一场涉及武器和游击队训练的致命阴谋。随着敌我局势愈加难分难解，派恩急迫揭露一场旨在扰乱国家安宁的阴谋，但背叛如影随形，他必须决定自己究竟需要赢得谁的信任，以及在为时已晚之前，自己愿意付出多大的代价。
女侠凌苍苍凭借着侠肝义胆和出奇制胜的武功，在江湖中创立了匡扶正义的门派凤来阁。南祁王朝年轻的皇帝萧焕一心为民，然而首辅大臣联合江湖势力把持朝政，祸乱百姓。萧焕为拯救苍生于苦难，化名“白迟帆”微服私访行走江湖，并认识了行侠仗义的凤来阁阁主凌苍苍。二人一起仗剑天涯，除暴安良 ，惺惺相惜，却不料凌苍苍就是首辅的女儿，并即将成为他的皇后。面对江湖动乱、百姓受难，心怀大义的萧焕和凌苍苍携手平乱赈灾、惩处贪墨。他们在为百姓谋福祉的过程中，也寻获了自己想要执剑江湖的初心，找到了自身的价值，那就是铁肩担道、热血为民，帮助百姓安居乐业，使得山河无恙、人间皆安。该剧改编自谢楼南的小说《我的皇后》。
